Samos antik limanı, Sisam adasında bugün Pythagorion'un bulunduğu bölgede, varlığı tarihçi Herodot'un yazılarından bilinen antik bir limandır. Herodot'un aktardığına göre Samos limanı oldukça büyük bir mendireğe sahipti. Herodot, bu mendireği zamanının en ileri Yunan mühendislik örneği olarak tanımlamıştır.